約五百年前、地球から百億光年離れた電波銀河３Ｃ３２４にある惑星ジニアにおいて、一人の天才が生まれた。その天才とは、後にジニア人に繁栄と滅亡をもたらすドクター・ブレインであった。少年期のブレインは、秀才揃いのジニア人の中でも際立って優秀だった。一つ例を挙げると、五歳の時、全身に癌が転移して末期症状だった患者をブレインが手術して治し、世間を驚かせた。
ジニア人の社会にも学校があり、ブレインも学校に通っていた。しかし、他のジニア人の子供達は、自分達より遥かに優れた頭脳を持つブレインを妬み、苛めた。そんなブレインを苛めっ子から助けてくれたのが、後にブレインの盟友となるラングであった。ラングは、頭脳だけでなく、身体能力も他のジニア人の子供達より格段に秀でていた。そんなラングも頭脳においてはブレインに敵わなかったが、ブレインを決して妬まなかった。
時が過ぎ、成人となったブレインは、画期的な手術方法を編み出した。それはジニア人の大き過ぎる脳を、その精度を一切下げる事なく大幅に縮小する手術だった。従来のジニア人の脳は、地球人の脳の倍以上の大きさがあり、そのせいで頭が肥大化し、誰もが二頭身だった。しかし、ブレインは、ラングを手術し、地球人の脳と同じ位の大きさの脳にする事に成功した。次にラングの頭全体を縮小する手術も行い、ラングは八頭身になった。
ブレインは、手術方法をラングに伝授し、ラングに自分を手術させた。こうしてブレインも二頭身ではなくなった。この手術は、過去に大勢の人が挑戦し、全員が失敗した。それをブレインが初めて成功させたのだから、このニュースが世間に広まると、全ジニア人が手術を希望した。ブレインは、その要望に応じ、ラングと手分けして手術を行った。手術を希望する人達の中には、過去にブレインを苛めた者達も居たが、彼等の手術だけ何故か失敗して死亡した。
同時にブレインは、ジニア人の肉体を二十歳位に若返らせ、不老になる手術も執り行った。手術を受けた人達は、肉体が何年経っても若い時のまま変わらない為、病気になり難くなった。その為、事故に遭ったり、危害を加えられたりしない限り、永遠に生きられるようになった。ブレインやラングも互いに手術し、共に年を取らない体になった。また、希望者には整形手術も執行して美顔にした。
ブレインは、人々から尊敬され、やがてジニア人の頂点に立った。そして、「この宇宙を隅から隅まで知り尽くそう」と皆に呼び掛けた。知的好奇心が旺盛なジニア人達は、この呼び掛けに賛同し、次々と他の星に進出した。最初は侵略せず、他の異星人達と仲良くなって、知識を教え合う平和的なやり方だった。
ところが、極秘だからという理由で教えてくれなかったり、折角教えてもらっても価値の無い無駄な知識ばかりだったので、ブレインは、次第に嫌気が差してきた。そして、遂に方針を一変させた。ブレインの判断基準で役に立たないと見なされた異星人達を容赦なく殺害した。一方、役に立つと思われるが、知識を教えない異星人達を拷問や洗脳し、知識を奪っていった。この頃からストマックは、口にこそ出さなかったが、ブレインに反感を抱くようになった。
異星人達を殺害する方法は、ジニア人によって様々だった。ブレインは、キラーウイルスという殺人ウイルスを開発し、それを用いて星に住む全ての生物を皆殺しにした。生物学を専攻しているキドニーは、「知的生命体だけでなく、全ての生物を皆殺しにしては、もし貴重な生物が住んでいる場合、その生物の研究が十分に出来なくなる」と言って抗議したが、聞き入れられなかった。
完全に侵略者と化したジニア人達は、支配した星を調査や研究し、知識を増やしていった。しかし、時間が掛かり過ぎる事を嫌ったブレインは、当初の目的であった知識を得る事を後回しにし、まずは星を攻め滅ぼすよう命令した。よほど役に立つと思われる人達か、ある程度役に立ちそうで命乞いをした人達だけは滅ぼされずに済み、それ以外は皆殺しにされた。
侵略領域を広げていくと、ジニア人だけでは人手が足りなくなっていった。そこで役に立つと見なされて殺されなかった異星人達を協力者として働かせる事にした。逆らえば殺されるのが分かっていたので、協力者となった者達は、嫌でも従わざるを得なかった。協力者達は、それぞれ得意分野に応じて仕事を割り振られた。
ジニア人に侵略された星に住んでいた人達の大半が殺されたが、命からがら別の星に逃げ延びた者達も居た。その者達が結集し、ジニア人に反撃を開始した。そして、不意を突かれて殺されるジニア人が続出した。どんなに警戒を強めても、何時、何処で、誰に襲われるか分からないので、完全には防げなかった。そして、遂にブレインまでもが襲われた。何とか助かったが、身の危険を感じたブレインは、自身の体をサイボーグに改造して身を守る事にした。
惑星ジニアのある銀河３Ｃ３２４を手中に収めた頃、ジニア人達は、互いを呼び合う際、名前の前に「ドクター」を付けるようになった。ラングは、「他人行儀みたいで嫌だ」と言い放ち、古くからの友人であるブレインを変わらず「ブレイン」と呼び捨てにしていたが、それ以外のジニア人には「ドクター」を付けて呼んだ。
３Ｃ３２４以外の銀河も侵略する事にしたブレイン改めドクター・ブレインは、各銀河毎に担当するジニア人を決め、生かす人種か殺す人種か判断するのも各ジニア人に任せる事にした。各ジニア人は、一つの銀河を征服する毎に期限を設けられ、その期限内に担当する銀河の知的生命体が住む星の全てを征服する事が義務付けられた。そして、その期限は、銀河の規模にもよるが、大抵一年だった。
期限を守れなかったジニア人に、何かペナルティがある訳ではなかった。しかし、よく期限を守る優秀なジニア人には、「オーガン」という称号を与えられた。逆に余り期限を守れない平凡なジニア人には、「ボーン」という称号を与えられた。ボーンとなったジニア人は、年齢や実績に関係なく、オーガンとなったジニア人に敬意を払わなければならなかった。
占領した銀河が増えるにつれ、ドクター・ブレインの野望も膨らんでいった。遂にドクター・ブレインは、何千億もある銀河の全てを占領する事にした。そして、ジニア人達が他の星への侵略を開始してから数えて千年の内に、全銀河を占領する事にした。これを「ミレニアムプロジェクト」と名付け、全ジニア人に通告した。多くのジニア人達が「千年なんて無理です」と言って反対したが、ドクター・ブレインの意志は変わらなかった。
ミレニアムプロジェクトが発表されてからというもの、ジニア人達は、寸暇を惜しんで担当する銀河の征服に勤しんだ。ところが、ドクター・ブレインには慌てる様子が無かった。ドクター・ブレインは、自身に対しても担当する銀河を割り振っていたが、異星人達の生殺判断や殺害を協力者達に任せ、研究に没頭していた。キラーウイルスを用いれば、その取り扱い方さえ誤らなければ、力が弱い者でも簡単に星に住む生物を全滅させられた。
ドクター・ブレインの研究とは、様々な病気の新たな治療法を編み出す事であった。その為に占領した星で拘束した者達を自身の研究所に集め、わざと病気にしてから治療した。治療が間に合わずに死んでしまう者が居た。誤った治療で死んでしまう者も居た。完治しても、すぐに別の病気にさせられた。病気と治療を繰り返されれば、どんな屈強な者でも体力を消耗し、長くても一ヶ月で死に至った。何年にも渡って生き延びたのは、後に捕らえられた悟飯だけであった。
ドクター・ブレインの楽しみは、占領した星から集められた美女を侍らす事であった。ある日、ドクター・ブレインは、一人の美女の身体に触った。身体を触られた美女は、悲鳴を上げずに黙って堪えた。ところが、美女が嫌々触られている事に気分を害したドクター・ブレインは、「私に体を触られて喜ばぬ女は、生きている価値が無い」と言い、その場で殺してしまった。これ以降、美女達は、ドクター・ブレインに体を触られる際、無理して笑顔を作った。
それから約四百年が過ぎた惑星ジニアで、一人の天才少女がドクター・ブレインの目に留まった。ハートという名の少女は、ドクター・ブレインかドクター・ラングにしか出来ないと言われている脳を縮小する手術に成功した。それもわずか十四歳の時であった。
ドクター・ブレインは、ハートに一つの銀河を攻めるよう命令した。それはオーガンでなければ太刀打ち出来ないとさえ言われる程に強者が多く住む銀河であった。ところが、ハートは、ハートボーグという強力なサイボーグを用い、その銀河を半年で征服した。気を良くしたドクター・ブレインは、直ちにハートにオーガンの称号を与えた。
ハート改めドクター・ハートは、他のジニア人の様に銀河を侵略する代わりに、惑星ジニアに残って全軍を管理し、指揮するよう命令された。ドクター・ブレインがドクター・ハートを特別扱いするのは、彼女が天才だからという理由だけではなかった。ドクター・ハートは、ドクター・ブレインからセクハラをされても、嫌な顔一つせず、いつも嬉しそうな顔をするからであった。ドクター・ハートは、ドクター・ブレインに対して好意を抱いていた。
惑星ジニアで大学を卒業したジニア人達は、自身が担当する銀河を割り振られ、続々と他の銀河に侵略していた。しかし、ミレニアムプロジェクトは遅々として進まなかった。このままでは千年で全ての銀河を征服するのが無理だと判断したドクター・ブレインは、全ジニア人を惑星ジニアに呼び戻し、「ジニア人のクローンを作ろう。そうすればミレニアムプロジェクトが一気に進むだろう」と呼び掛けた。しかし、ほとんどのジニア人が反対した。
更に約百年が経過したある日、惑星ジニアに居るドクター・ハートからドクター・ブレインに報告があった。「サイヤ人を捕獲した」と。大昔に様々な銀河で暴れ回った伝説の戦闘種族に興味が沸いたが、色々とやる事があり、すぐに惑星ジニアへの帰還が叶わなかったが、折を見て惑星ジニアに戻り、そのサイヤ人を人体実験したいと思った。しかし、その事が後に自身の破滅を招く事になろうとは、さしものドクター・ブレインも気付いていなかった。
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